1、余甘子果实中含有黄酮类化合物;维生素c，维生素b1，维生素b2,胡萝卜素，维生素a，维生素pp等，尤其富含维生素c，其含量可达0.6%～0.92%，春季果实含量最高，有时甚至可达1.82%，该含量是苹果维c含量的160倍，同时也是柑橘含量的100倍，仅次于水果维生素c之王的刺梨。更可贵的是余甘子果实中所含维生素c在高温高热下十分稳定。
2、余甘子含17种氨基酸，包括了人体所需的8种氨基酸，其氨基酸总含量达185mg/100g，主要有谷氨酸，脯氨酸，天冬氨酸，丙氨酸，赖氨酸。
3、余甘子还含有多种微量元素，其含量比苹果丰富，主要有硒、锌、钙、磷、铁、钾等。
4、余甘子种子含脂肪酸26%，主要包括：亚麻酸，亚油酸，油酸，硬脂酸，棕榈酸，肉豆蔻酸等。